セキュリティーニュース
http://d.hatena.ne.jp/ockeghem/20110620
PHPの現行バーション(PHP5.3.6以前)には、ファイルアップロード時のファイル名がルート直下の場合、先頭のスラッシュを除去しないでファイル名が渡される問題があります。CVE-2011-2202として報告されています。
次バージョンPHP5.3.7のRC1で修正されていることを確認しましたので、PHP5.3.7正式版が公開され次第、できるだけ早期に導入することを推奨します。